Elite Ultraman โดยผู้สร้าง สมโพธิ แสงเดือนฉายอุลตร้าแมน เอลิท เป็นชาวดาว M78 อายุ 2,400 ปี ซึ่งเป็นน้องเล็กสุดในเหล่าพี่น้องอุลตร้า และเป็นอุลตร้าแมนตัวใหม่ ที่ถูกสร้างขึ้นจาก DNA ของอุลตร้าแมน มิลเลเนียม เดินทางมาบนโลกเมื่อปี 2004 และอาศัยร่างของทหารหนุ่ม เป็นร่างแปลงของตน
ร้อยเอกเอลิท นายทหารของรัฐบาลฮ่องกง ถูกส่งมาประจำโครงการวิจัย Project Ultraman ได้รับภารกิจตามล่าตัวนีล หนูทดลองที่หนีออกจากศูนย์วิจัย กลับมาเพื่อทำการทดลองต่อให้สำเร็จ
ในระหว่างที่ไล่ล่ากันอยู่นั้น ได้เกิดเหตุการณ์สัตว์ประหลาดบุกโลก ผู้กองเอลิทจึงแปลงร่างเป็นUltraman Elite เข้าต่อสู้กับสัตว์ประหลาด แต่เนื่องจากความไม่สมบูรณ์ของ DNA อุลตร้าทำให้ Ultraman Elite พลาดท่าจนเกือบต้องตาย
ขณะที่ Ultraman Elite กำลังแย่เขาได้รับการช่วยเหลือจาก Ultraman Millennium หรือนีลจนทั้งคู่รอดตายมาได้ หลังจากนั้น เอลิทรู้สึกประทับใจ และเห็นใจนีล เขาจึงช่วยเหลือนีล ด้วยการพูดเกลี้ยกล่อมรัฐบาล ให้เลิกไล่ล่าตัวนีล
หลังจากนั้นทั้ง Ultraman Elite และ Ultraman Millennium ก็ร่วมมือกันต่อสู้กับเหล่าสัตว์ประหลาดที่บุกโลก และได้สู้กับ Dark Ultraman ที่ถูกด้านมืดเข้าครอบงำ แต่ภายหลัง ทั้ง อุลตร้าแมน เอลิท,อุลตร้า มิลเลนเนี่ยม และ ดาร์ค อุลตร้าแมน ก็ร่วมมือกันต่อสู้กับเหล่าสัตว์ประหลาด
พลังและความสามารถของ Ultraman Elite คือการปรับความสมดุลระหว่างมนุษย์และจุลชีวิต สามารถเคลื่อนไหวได้อย่างรวดเร็ว ไม่ว่าจะอยู่มิติใดก็ตาม และสามารถรักษาสมดุลเหล่าธรรมชาติและจักรวาลได้อย่างดี
